Perawatan tanaman cabai hidroponik merupakan aspek penting yang tidak boleh diabaikan meskipun terlihat lebih sederhana dibanding metode konvensional. Kontrol nutrisi dan air sangat diperlukan, dimana larutan nutrisi harus selalu tersedia dan air harus tetap bersih untuk mencegah pertumbuhan jamur atau alga. Pencahayaan juga menjadi faktor penting dalam pertumbuhan cabai, dimana cabai membutuhkan sinar matahari minimal 6-8 jam per hari atau bisa menggunakan lampu khusus tanaman jika ditanam di dalam ruangan. Pengendalian hama dan penyakit juga menjadi perhatian penting dalam budidaya tanaman hidroponik, dengan penggunaan pestisida organik secara berkala namun tetap hati-hati agar tidak merusak tanaman.
Pemupukan tambahan dengan penyemprotan pupuk cair juga bisa membantu meningkatkan pertumbuhan dan merangsang pembungaan tanaman cabai. Keseimbangan antara nutrisi dan pengendalian hama dinilai sangat penting untuk keberhasilan budidaya cabai hidroponik menurut sumber pertanian. Salah satu keunggulan metode budidaya ini adalah waktu panen yang relatif cepat, dimana cabai mini sudah bisa dipanen dalam waktu 80-90 hari dengan perawatan yang optimal.
Ciri-ciri cabai siap panen antara lain adalah warna merah cerah, tekstur buah yang padat, dan masih terdapat sedikit garis hijau. Waktu panen juga perlu diperhatikan agar menjaga kualitas dan bobot cabai. Disarankan untuk memanen pada waktu pagi atau sore agar buah tidak cepat layu.
